R语言高效的操作技巧有哪些

其他教程   发布日期:2025年04月23日   浏览次数:211

这篇文章主要介绍了R语言高效的操作技巧有哪些的相关知识,内容详细易懂,操作简单快捷,具有一定借鉴价值,相信大家阅读完这篇R语言高效的操作技巧有哪些文章都会有所收获,下面我们一起来看看吧。

R语言中的一些特殊技艺

1 修改默认提示语言

R默认提示的语言有的人是英文,有的人是中文,这是因为每个人系统默认语言不同,可以通过下面方式进行修改

  1. Sys.getlocale() #显示系统语言
  2. Sys.setenv(LANG="en") # 更换默认语言为英文

2 查看R所消耗内存大小

可以使用memory.size() #获取内存大小,不过该函数值只是和windows系统。

  1. memory.size() #获取内存大小
  2. [1] 341

3 查看某个数据集内存大小

  1. > object.size(mtcars)
  2. 7208 bytes
  3. > object.size(mtcars)/1024 #以kb显示
  4. 7 bytes

4 代码中换行

默认回车是运行代码,在Rstudio中有自动补齐,比如定义一个函数,直接自动补齐了{},回车就运行了,可以使用shift+enter #换行

  1. function(x,y) {
  2. }

5 边赋值边显示

默认赋值完,直接敲变量名就打印数据,可以利用下面方式一步完成两个操作。

  1. (x <- runif(10))
  2. [1] 0.5795985 0.4661326 0.9730974 0.6697417 0.2431985 0.3988545 0.4064351 0.8403910
  3. [9] 0.3136191 0.9979925

7 查看源代码

如果想查看R函数的源代码,直接输入函数名,不加括号即可。

  1. > mean
  2. function (x, ...)
  3. UseMethod("mean")
  4. <bytecode: 0x0000023e3b8db998>
  5. <environment: namespace:base>

8 利用函数修改镜像

如果不设置R镜像,每次安装R包是都会弹出选择框,可以在安装之前通过函数进行设置,使用chooseCRANmirror()函数,给定ind选项一个数值即可。数值代表镜像编号。

  1. > chooseCRANmirror()
  2. Secure CRAN mirrors
  3. 1: 0-Cloud [https] 2: Australia (Canberra) [https]
  4. 3: Australia (Melbourne 1) [https] 4: Australia (Melbourne 2) [https]
  5. 5: Australia (Perth) [https] 6: Austria [https]
  6. 7: Brazil (BA) [https] 8: Brazil (PR) [https]
  7. 9: Brazil (RJ) [https] 10: Brazil (SP 1) [https]
  8. 11: Brazil (SP 2) [https] 12: Bulgaria [https]
  9. 13: Canada (MB) [https] 14: Chile (Santiago) [https]
  10. 15: China (Beijing 2) [https] 16: China (Hefei) [https]
  11. 17: China (Hong Kong) [https] 18: China (Guangzhou) [https]
  12. > chooseCRANmirror(ind = 18)

9 显示更多数据

默认R显示1000行数据,如果想显示更多,可以通过设置max.print选项。

  1. > options('max.print')
  2. $max.print
  3. [1] 1000
  4. > options('max.print'=2000)
  5. > options('max.print')
  6. $max.print
  7. [1] 2000

10 默认保留小数点

默认R显示7为小数,如果想默认保留两位小数,可以通过设置digits选项。

  1. > options('digits')
  2. $digits
  3. [1] 7
  4. > options('digits'=2)
  5. > options('digits')
  6. $digits
  7. [1] 2

11 管道

使用管道让代码更加简洁,无需定义过多中间变量。R中的管道符号为“%>%”如果要使用管道,需要加载magrittr包。其实Rstudio出的各种包都默认支持管道,如果加载了tidyverse包也是可以。

  1. > library(magrittr)
  2. > library(ggplot2)
  3. > mtcars %>% ggplot(aes(x=cyl,y=mpg,group=cyl))+geom_boxplot()

12 拆分列数据

有些时候记不住列名,或者容易拼错,想要列名也能够自动补齐,可以使用attach函数,这样每一列就变成一个独立的变量。

  1. attach(mtcars)
  2. > cyl
  3. [1] 6 6 4 6 8 6 8 4 4 6 6 8 8 8 8 8 8 4 4 4 4 8 8 8 8 4 4 4 8 6 8 4
  4. > mpg
  5. [1] 21.0 21.0 22.8 21.4 18.7 18.1 14.3 24.4 22.8 19.2 17.8 16.4 17.3 15.2 10.4 10.4
  6. [17] 14.7 32.4 30.4 33.9 21.5 15.5 15.2 13.3 19.2 27.3 26.0 30.4 15.8 19.7 15.0 21.4

13 默认加载包

如果一些包经常使用,想要启动R之后自动加载,可以在配置文件中进行设置,例如每期启动R,自动加载ggplot2包。

  1. file.edit("~/.Rprofile")
  2. .First <- function() {
  3. library(ggplot2)
  4. }

14 为R添加额外扩展包加载路径

默认R包的加载目录在.libPaths()目录中,当然可以为其添加更多的路径。

  1. > .libPaths()
  2. [1] "C:/Users/genom/Documents/R/win-library/4.0"
  3. [2] "C:/Program Files/R/R-4.0.3/library"
  4. > .libPaths(new = "C:/Users/genom/Desktop/nparFiles/")
  5. > .libPaths()
  6. [1] "C:/Users/genom/Desktop/nparFiles" "C:/Program Files/R/R-4.0.3/library"

15 迁移R包

如果需要将一台设备安装的R包,在另外一台设备上安装,首先保存A设备上的R包名字列表,在另外一台设备上写一个循环进行安装。

  1. #在A设备上保存名字列表
  2. oldip <- installed.packages()[,1]
  3. save(oldip,file = "installedPacckages.Rdata")
  4. #在B设备上进行安装;
  5. load("installedPacckages.Rdata")
  6. newip <- installed.packages()[,1]
  7. for (i in setdiff(oldip,newip)) {
  8. install.packages(i)
  9. }

16 列出R包中的函数

如果想查看一个R包中全部函数,可以使用下面的语句。

  1. ls(package:base)

17 不加载包使用其中函数

如果加载R包,还想使用其中的函数,需要使用“包名字::函数名”的方式。

  1. dplyr::filter()

18 快速获取颜色

在绘图的时候,想要快速设置几个不同的颜色,又嫌生成颜色比较麻烦。可以使用rainbow()函数,给定一个数据,快速生成颜色。

  1. > rainbow(6)
  2. [1] "#FF0000" "#FFFF00" "#00FF00" "#00FFFF" "#0000FF" "#FF00FF"

19 炸开数据

前面介绍了attach函数可以将每一列变成一个单独变量,但这种方式并不推荐,因为会让变量环境很混乱。可以使用一个特殊管道符"%$%"实现同样的效果,我称之为把数据“炸开”

  1. > library(magrittr)
  2. Warning message:
  3. 程辑包‘magrittr'是用R版本3.6.3 来建造的
  4. > women %$% plot(weight,height)

20 巧用example函数学习绘图

example函数会帮助运行R帮助文档中的代码,有时候想看一个函数如何使用,可以直接运行这个example函数。

  1. > library(pheatmap)
  2. > example("pheatmap")
  3. phetmp> # Create test matrix
  4. phetmp> test = matrix(rnorm(200), 20, 10)
  5. phetmp> test[1:10, seq(1, 10, 2)] = test[1:10, seq(1, 10, 2)] + 3
  6. phetmp> test[11:20, seq(2, 10, 2)] = test[11:20, seq(2, 10, 2)] + 2
  7. phetmp> test[15:20, seq(2, 10, 2)] = test[15:20, seq(2, 10, 2)] + 4
  8. phetmp> colnames(test) = paste("Test", 1:10, sep = "")
  9. phetmp> rownames(test) = paste("Gene", 1:20, sep = "")
  10. phetmp> # Draw heatmaps
  11. phetmp> pheatmap(test)

21 统计计算时间

想统计一条代码运行时间,可以使用system.time()函数

  1. > system.time(runif(100000000))
  2. 用户 系统 流逝
  3. 2.75 0.08 2.83

21 释放内存

R有一套自己的内存回收机制,因此,即使删除了变量,内存不会立即变化,可以使用gc()函数释放内存。

  1. > memory.size()
  2. [1] 297.56
  3. > rm(list = ls())
  4. > memory.size()
  5. [1] 298.54
  6. > gc()
  7. used (Mb) gc trigger (Mb) max used (Mb)
  8. Ncells 1384255 74.0 4046672 216.2 4046672 216.2
  9. Vcells 4288164 32.8 27057220 206.5 33821525 258.1
  10. > memory.size()
  11. [1] 255.5

22 删除全部变量

  1. #显示全部变量内容
  2. > ls()
  3. #删除
  4. > rm(list=ls())
  5. #释放内存
  6. > gc()

23 恢复默认数据集

如果不小心将内置数据集删除了,或者新定义同名变量,就会替换原有数据集。

  1. head(mtcars)
  2. mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb
  3. Mazda RX4 21.0 6 160 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4
  4. Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4
  5. Datsun 710 22.8 4 108 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1
  6. Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1
  7. Hornet Sportabout 18.7 8 360 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2
  8. Valiant 18.1 6 225 105 2.76 3.460 20.22 1 0 3 1
  9. > mtcars=1:10
  10. > mtcars
  11. [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
  12. > data("mtcars")
  13. > head(mtcars)
  14. mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb
  15. Mazda RX4 21.0 6 160 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4
  16. Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4
  17. Datsun 710 22.8 4 108 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1
  18. Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1
  19. Hornet Sportabout 18.7 8 360 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2
  20. Valiant 18.1 6 225 105 2.76 3.460 20.22 1 0 3 1
  21. >

24 快速获取函数选项参数

R函数的选项参数非常多,如果每次都调出帮助文档很麻烦,可以使用args()函数,快速打印出函数的选项参数。

  1. > args(heatmap)
  2. function (x, Rowv = NULL, Colv = if (symm) "Rowv" else NULL,
  3. distfun = dist, hclustfun = hclust, reorderfun = function(d,
  4. w) reorder(d, w), add.expr, symm = FALSE, revC = identical(Colv,
  5. "Rowv"), scale = c("row", "column",
  6. "none"), na.rm = TRUE, margins = c(5, 5), ColSideColors,
  7. RowSideColors, cexRow = 0.2 + 1/log10(nr), cexCol = 0.2 +
  8. 1/log10(nc), labRow = NULL, labCol = NULL, main = NULL,
  9. xlab = NULL, ylab = NULL, keep.dendro = FALSE, verbose = getOption("verbose"),
  10. ...)
  11. NULL

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